Für Michael Meyns ist der Film im Herzen ein Film über das Erwachsen geworden, "über Freundschaft und die erste Liebe. Die ernsten Themen werden dabei stilistisch mit leuchtenden Farben kontrastiert, die dem Film jene typische Leichtigkeit verleihen, wie er dem japanischen Animationskino eigen ist. Zwar erreichen die Hintergründe und Animationen nicht die Detailfreude der Filme Hayao Miyazakis oder Kon Satochis reichen aber vollkommen aus, um eine intelligente, komplexe Geschichte zu erzählen."